Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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