Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Odf1Q61999 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Odf1Q61999 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Odf1Q61999 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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