Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Npm1Q61937 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms