Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga7Q61738 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms