Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad21Q61550 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms