Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms