Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd53Q61451 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms