Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vsx2Q61412 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms