Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms