Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf12Q61286 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms