Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc9a1Q61165 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a1Q61165 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a1Q61165 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc9a1Q61165 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms