Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc1Q61056 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms