Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf3Q60980 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms