Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms