Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RelnQ60841 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RelnQ60841 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RelnQ60841 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RelnQ60841 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RelnQ60841 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelnQ60841 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelnQ60841 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms