Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms