Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms