Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epha1Q60750 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms