Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk2a1Q60737 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms