Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samhd1Q60710 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms