Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgaeQ60677 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms