Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr1h2Q60644 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr1h2Q60644 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms