Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms