Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CttnQ60598 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms