Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc125Q5U465 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms