Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Trim38Q5SZ99 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim38Q5SZ99 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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