Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms