Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms