Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Sco1Q5SUC9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms