Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap44Q5SSM3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms