Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms