Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmprss11eQ5S248 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss11eQ5S248 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms