Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

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Length 778 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Brsk1Q5RJI5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Brsk1Q5RJI5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Brsk1Q5RJI5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Brsk1Q5RJI5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Brsk1Q5RJI5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brsk1Q5RJI5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Brsk1Q5RJI5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms