Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh12Q5RJH3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh12Q5RJH3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms