Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms