Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim58Q5NCC9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim58Q5NCC9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms