Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1810065E05RikQ5NC41 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms