Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clhc1Q5M6W3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clhc1Q5M6W3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms