Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8bQ5DU41 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms