Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rtl5Q5DTT4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtl5Q5DTT4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms