Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Urb1Q571H0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urb1Q571H0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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