Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrig2Q52KR2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms