Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otol1Q4ZJM7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms