Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lin28bQ45KJ6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lin28bQ45KJ6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lin28bQ45KJ6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lin28bQ45KJ6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lin28bQ45KJ6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lin28bQ45KJ6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms