Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim26Q3V460 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms