Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ulk4Q3V129 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms