Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms