Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm906Q3V0M1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm906Q3V0M1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms