Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms