Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfi1Q3UZY0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfi1Q3UZY0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms